122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3000 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 335 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  51.18 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  50.78 
 
 		 355 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  50.39 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  46.79 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  49.8 
 
 		 355 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  47.81 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  48.02 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  50.2 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  40.57 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  38.72 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  42.19 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  36.84 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  36.43 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  37.88 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  35.92 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  35.12 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  35.56 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  33.09 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  33.68 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  24.25 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.55 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.09 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  29.89 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  31.93 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  30.59 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  28.87 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.55 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.35 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.07 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  30.72 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.81 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.64 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.33 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  32.48 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  30.12 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  28.34 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  27.59 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  27.31 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  31.95 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  31.39 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  30.72 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  29.59 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  28.67 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  25.1 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.77 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  29.2 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  30.08 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  31.75 
 
 		 971 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  28.21 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  21.85 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.51 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  25.53 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  25 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.43 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  23.86 
 
 		 595 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  32.03 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  31.29 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  26.38 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  28.41 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  25.19 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  32.42 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  24.39 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  27.27 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  22.79 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  22.49 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>