71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0786 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  100 
 
 
327 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  49.32 
 
 
353 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  47.75 
 
 
346 aa  245  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  47.5 
 
 
354 aa  242  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  53.44 
 
 
333 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  47.5 
 
 
355 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  48 
 
 
355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  44.95 
 
 
325 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  47.81 
 
 
335 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  46.18 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  50.79 
 
 
359 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  43.54 
 
 
326 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  43.1 
 
 
353 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  42.22 
 
 
333 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  36.54 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  34.97 
 
 
334 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  38.57 
 
 
330 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  32.98 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  34.77 
 
 
342 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.84 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.36 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  29.92 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  24.7 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  24.7 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  26.78 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  26.92 
 
 
328 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  30.71 
 
 
334 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  25.14 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.49 
 
 
334 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.96 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  28.93 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  27.63 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  27.2 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  26.75 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  29.33 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  28.66 
 
 
352 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  25.43 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  23.53 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  29.03 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  31.08 
 
 
282 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  24.88 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  29.27 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  23.27 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  25.66 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 
754 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  21.86 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  23.32 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  21.46 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.36 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.61 
 
 
352 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  23.36 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  21.46 
 
 
335 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  28.28 
 
 
359 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 
358 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 
342 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  27.91 
 
 
344 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>