102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3804 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  100 
 
 
332 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  58.04 
 
 
328 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  46.95 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  50.16 
 
 
330 aa  255  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  50.52 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  38.83 
 
 
325 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  36.73 
 
 
353 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  38.03 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  35.11 
 
 
326 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  34.98 
 
 
354 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  35.23 
 
 
355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  33.45 
 
 
327 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  35.13 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  30.35 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  34.33 
 
 
333 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  34.84 
 
 
326 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  35.56 
 
 
335 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  35.79 
 
 
359 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  24.75 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  23.48 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.45 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  22.79 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  23.53 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  22.79 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.94 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  20.65 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  26.82 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  25 
 
 
328 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  20.65 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  20.65 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  23.84 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  20.68 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  23.28 
 
 
343 aa  62.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  21.21 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  23.24 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  23.38 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.6 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  24.7 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  22.32 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  23.72 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.73 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  20.74 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  25.51 
 
 
352 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  19.08 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  19.08 
 
 
338 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  21.24 
 
 
327 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  26.03 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.54 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  18.75 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.14 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  26.54 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  19.78 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  25.97 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  24.76 
 
 
318 aa  55.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
339 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  25.15 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  21.45 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  19.46 
 
 
309 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.47 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 
345 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  25.69 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  26.21 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  25.74 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  25.81 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 
358 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  19.2 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  26.35 
 
 
329 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  21.35 
 
 
334 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.49 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 
342 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  23.31 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  26.99 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  28 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  23.72 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  25.16 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  24.9 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  25.83 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  23.36 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  24.22 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  24.16 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 
344 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  19.94 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  26.3 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  18.97 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  26 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1218  hypothetical protein  27.1 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  22.63 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  31.43 
 
 
795 aa  43.5  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>