87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3275 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  100 
 
 		 342 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  68.88 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  57.14 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  54.24 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  52.2 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  40.96 
 
 		 353 aa  208  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  38.26 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  34.21 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  31.39 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  34.4 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  34.17 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 354 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  34.77 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  33.22 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  36.47 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  29.15 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  31.78 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  32.78 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  24.56 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  33.79 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  24.32 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  24.82 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  21.9 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  26.14 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  27.37 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  26.51 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  23.63 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  24.49 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  26.35 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  25.37 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  28.26 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  25.64 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.32 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  23.29 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.74 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  26.57 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.65 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  23.88 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  23.88 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 		 332 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  24.84 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.94 
 
 		 364 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  22.51 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  22.27 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.46 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  20 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  22.08 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.17 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  20.14 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  23.19 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  24.64 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  19.93 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  21.48 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  19.93 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  19.93 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  19.58 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  22.43 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  19.93 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  23.45 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  25.81 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  20.9 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  24.9 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  18.85 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  21.03 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  22.7 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  18.75 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  18.75 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  24.66 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  22.92 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  23.25 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  19.64 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>