79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4203 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 359 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  80.52 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  80.39 
 
 		 355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  80 
 
 		 354 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  69.45 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  55.84 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  49.63 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  52.21 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  51.48 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  46.69 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  44.48 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  41.91 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  42.86 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  40.21 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  38.02 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  38.72 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  39.54 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  36.76 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  37.38 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  35.09 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  32.91 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  30.61 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  34.23 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  29.71 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  29.85 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  30.32 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  30.14 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  30.11 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  24.81 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  28.72 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  24.1 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  31.97 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  29.45 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  29.75 
 
 		 320 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.17 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  26.38 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 		 335 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  26.07 
 
 		 335 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  31.44 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  35.51 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  31.84 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  31.44 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.5 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.5 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  32.5 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  25.74 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  33.09 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26.45 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  25.36 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.74 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.35 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  27.54 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  24.36 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  27.67 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.96 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  28.42 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  24.36 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  30.7 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  24.36 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  24.77 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.45 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  20.3 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  24.34 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  34.29 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  32.06 
 
 		 320 aa  43.1  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  23.58 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>