78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4625 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 354 aa  694    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  95.25 
 
 		 355 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  94.07 
 
 		 355 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  77.81 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  65.52 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  54.55 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  47.48 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  49.29 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  50.62 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  43.12 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  43.58 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  37.38 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  40 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  39.68 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  37.67 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  35.56 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  35.43 
 
 		 342 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  35.84 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  36.77 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  36.83 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25.22 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.22 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  27.9 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  25.44 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  23.08 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  24.24 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  32.19 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.76 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  24.43 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  29.45 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  23.47 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  27.89 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.42 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  27.45 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  30.12 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  30.52 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  26.04 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  32.03 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  25.09 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  28.89 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.85 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26.49 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  33.77 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  23.03 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  22.81 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.46 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  27 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.83 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  33.11 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  23.34 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  24.26 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  23.84 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  33.33 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  26.94 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  24.38 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  29.8 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.4 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  24.39 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>