32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1893 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  100 
 
 		 353 aa  701    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  42.49 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  40.25 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  43.43 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  40.38 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  43.24 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  37.2 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  36.99 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  38.49 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  38.93 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  37.91 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  36.71 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  38.78 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  33.64 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  37.3 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  35.49 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  39.64 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  40.43 
 
 		 359 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  35.93 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  23.21 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  23.01 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.12 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  26.79 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  23.1 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  26.61 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  22.55 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.42 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  25.47 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.46 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>