50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1822 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
326 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  47.23 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  46.37 
 
 
327 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  44.19 
 
 
353 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  44.04 
 
 
355 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  43.84 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  44.12 
 
 
354 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  42.71 
 
 
333 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  42.75 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  39.34 
 
 
346 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  45.17 
 
 
359 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  42.38 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  38.38 
 
 
353 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  36.82 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  42.32 
 
 
335 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  37.05 
 
 
342 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  30.32 
 
 
326 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  39.63 
 
 
330 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  33.45 
 
 
328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  36.4 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  26.58 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  32.61 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.56 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25.56 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  26.73 
 
 
335 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  33.77 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  28.21 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
324 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.53 
 
 
317 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  29.87 
 
 
328 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  29.87 
 
 
328 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  22.7 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  25.79 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  21.76 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  26.14 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  27.41 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  28.39 
 
 
340 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  25.42 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.03 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  26.36 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.81 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  19.71 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 
325 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  20.81 
 
 
328 aa  42.7  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>