93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8033 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 353 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  67.76 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  68.71 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  68.73 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  71.78 
 
 		 359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  56.6 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  50.18 
 
 		 327 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  50.37 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  45.3 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  50.21 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  44.52 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  42.18 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  40.69 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  38.87 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  37.68 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  35.85 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  34.51 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  35.23 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.16 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  26.88 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  30.61 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  26.76 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  24.33 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  31.13 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  20.66 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  26.39 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  32.86 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  30.88 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  24.63 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  31.11 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  23.56 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  22.88 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  31.45 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.95 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  23.57 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  21.84 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  32.03 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  25.48 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  24.75 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  23.57 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  24.38 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  23.57 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  30.65 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  23.95 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  26.63 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2991  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.09 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 		 339 aa  46.2  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  19.01 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.26 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  28.26 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  23.19 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  25.18 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  25.18 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  23.57 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  20.43 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  23.57 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  30.15 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.21 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25.55 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.36 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  24 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  24.11 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  28.46 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  26.45 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.77 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>