41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1914 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 333 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  47.73 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  48.99 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  51.26 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  52.81 
 
 		 327 aa  255  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  49.12 
 
 		 354 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  50.92 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  52.67 
 
 		 359 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  47.86 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  43.57 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  40.28 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  42.86 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  42.42 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  34.43 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  37.89 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  32.89 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  34.93 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  33.46 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  30.36 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  32.95 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.65 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.08 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  40.65 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  39.84 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  28.08 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  31.5 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  21.4 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  32.72 
 
 		 359 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  21.84 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  29.92 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.17 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  33.61 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  31.71 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  24.21 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.71 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.59 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>