77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3050 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 334 aa  680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  69.28 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  55.35 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  49.85 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  46.95 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  39.75 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  35.24 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  36.63 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  34.88 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  34.11 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  34.72 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  29 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  36.21 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  34.67 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 		 355 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  38.44 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  35.16 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  31.08 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  26.55 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  27.34 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1204  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  27.34 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.34 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  26.97 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  27.24 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  26.57 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.44 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  26.49 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  24.09 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  28.22 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.44 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  23.26 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  25.43 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.67 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  24.02 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  24.58 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  24.31 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  22.67 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  22.67 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 329 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  22.58 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  25.56 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  24.24 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  23.04 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  23.67 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  25.55 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  24.82 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  24.11 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  27.62 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  21.89 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  25.45 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  24.12 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.26 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  22.57 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  25 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  24.44 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  23.39 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  20.8 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>