80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4143 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 355 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  96.62 
 
 		 355 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  94.03 
 
 		 354 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  79.64 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  65.63 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  56.27 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  50.5 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  48.33 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  50.62 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  44.2 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  43.58 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  41.04 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  37.59 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  39.21 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  38.7 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  36.6 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  38.31 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  35.43 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  36.66 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  36.83 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25.85 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  24 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  27.14 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  26.15 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  26.15 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  32.62 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  25.94 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  25.69 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  28.76 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  24.29 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  24.29 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  29.45 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  23.93 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  21.2 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  23.77 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.9 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  26.49 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  28.21 
 
 		 352 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  24.03 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  23.68 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  26.14 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  32.86 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  25.82 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  30.12 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  23.45 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  24.01 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  33.99 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  24.01 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  27.04 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.87 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.19 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  23.1 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.85 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  22.83 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 		 324 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  23.2 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  27.07 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1739  von Willebrand factor type A  23.9 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0006  von Willebrand factor, type A  32.09 
 
 		 592 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  23.65 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  28.17 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  31.03 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>