76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1528 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1528  MxaC protein, putative  100 
 
 		 325 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2037  von Willebrand factor, type A  47.2 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0786  MxaC protein, putative  45.36 
 
 		 327 aa  221  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8033  von Willebrand factor type A  46.18 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1822  von Willebrand factor, type A  47.33 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4511  von Willebrand factor type A  44.53 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0819187  normal  0.539104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4143  von Willebrand factor type A  44.49 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1898  von Willebrand factor, type A  42.05 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4625  von Willebrand factor type A  43.07 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  0.846338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1893  MxaC protein, putative  43.85 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0919467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1914  von Willebrand factor, type A  43.59 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0478  von Willebrand factor type A  40.14 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2418  putative MxaC-like protein  38.89 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4030  von Willebrand factor, type A  40.91 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0690  von Willebrand factor, type A  35.08 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4203  von Willebrand factor type A  47.31 
 
 		 359 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal  0.353652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3804  von Willebrand factor type A  39.68 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3050  von Willebrand factor type A  35.45 
 
 		 334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3275  MxaC protein, putative  37.87 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0556596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3000  von Willebrand factor, type A  40.57 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0367852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  24.46 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  22.86 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  28.86 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  32.85 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.99 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  26.71 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  22.95 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1386  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796868  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  25.59 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0791  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 533 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0865  von Willebrand factor type A  26.35 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0877751  normal  0.04584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  30.82 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  36.3 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  35.56 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  29.6 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  26.94 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  24.37 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  24.75 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  30.82 
 
 		 328 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  23.68 
 
 		 335 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  28 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  23.85 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  24.01 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  23.68 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  23.68 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  27.4 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.35 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  23.66 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  24.76 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  25.69 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  23.3 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  29.03 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  35.61 
 
 		 500 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  24.23 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  24.23 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  32.85 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  25.85 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  23.35 
 
 		 338 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  27.57 
 
 		 352 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>