72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0657 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0657  thiamine monophosphate kinase-like protein  100 
 
 
293 aa  570  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0170  thiamine monophosphate kinase-like protein  72.7 
 
 
284 aa  381  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1202  thiamine monophosphate kinase-like protein  68.79 
 
 
284 aa  381  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0185  thiamine monophosphate kinase-like protein  66.55 
 
 
284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1646  thiamine monophosphate kinase-like protein  43.4 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220659 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  26.2 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1216  AIR synthase related protein  26.84 
 
 
316 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0540136  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  32.09 
 
 
292 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0019  AIR synthase-like protein  23.71 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.213041  decreased coverage  0.00139533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0476  thiamine-phosphate kinase  28.92 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  24.03 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3484  thiamine-monophosphate kinase  30.23 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  28.34 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  29.55 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  30.39 
 
 
361 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  24.89 
 
 
315 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1297  thiamine-monophosphate kinase  29.05 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2151  thiamine-monophosphate kinase  29.14 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  25.77 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  24.89 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.86 
 
 
539 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  25.74 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  27.51 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  23.42 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  21.72 
 
 
350 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  28.42 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  28.51 
 
 
352 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1543  thiamine-monophosphate kinase  25.11 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0460  thiamine-monophosphate kinase  24.36 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  27.89 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  22.3 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1515  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
295 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  24.72 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  24.82 
 
 
358 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  29.86 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  27 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  24.4 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  29.91 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  26.21 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  23.11 
 
 
314 aa  48.9  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  26.22 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  22.29 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  26.43 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  24.33 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  25.62 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  24.21 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  23.86 
 
 
318 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  24.58 
 
 
315 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  28.62 
 
 
332 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  26.86 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  27.36 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  26.45 
 
 
344 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  26.67 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  22.41 
 
 
346 aa  45.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  22.65 
 
 
346 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  24.23 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  28.75 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  23.79 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  26.12 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  26.44 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  27.35 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  24.83 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.31 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  27.11 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  25.2 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  26.82 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  22.51 
 
 
371 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  25.1 
 
 
332 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  23.53 
 
 
341 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  21.38 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  23.32 
 
 
324 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>