More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0640 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  100 
 
 
371 aa  754    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  27.56 
 
 
325 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  30.74 
 
 
332 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  27.84 
 
 
352 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  26.02 
 
 
350 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  26.77 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  25.87 
 
 
346 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  26.17 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  27.74 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  28.52 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  25.95 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  24.76 
 
 
352 aa  93.2  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  25.48 
 
 
323 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  28 
 
 
306 aa  93.2  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  28.57 
 
 
346 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  25.32 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  24.52 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  25.88 
 
 
327 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  26.2 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  24.63 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  25.14 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  23.66 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  24.85 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  24.76 
 
 
328 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  26.1 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  24.34 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  28.22 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  25.61 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  24.77 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  26.52 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  28.38 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  23.08 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  26.54 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  27.85 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.259718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  24.76 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  23.15 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  27.78 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  24.83 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  23.42 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  26.59 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  25.15 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  25.24 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  23.76 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  23.47 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  23.56 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  27.31 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  27.31 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  27.16 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0436  succinate dehydrogenase  25.44 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  25.5 
 
 
325 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  25.24 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  26.49 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.554976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  22.45 
 
 
288 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  26.51 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  22.64 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  26.82 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  28.02 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  23.17 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  27.31 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  25.19 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  27.97 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  25.45 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  24.92 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  24.21 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  23.49 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  25.22 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  26.27 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  23.62 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  24.77 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  28.42 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  24.68 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  24.22 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  25.56 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  25.61 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.3 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0343133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1456  thiamine-monophosphate kinase  23.95 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  24.24 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2319  thiamine-monophosphate kinase  24.35 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4320  thiamine-monophosphate kinase  24.5 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.267415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  23.03 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1448  thiamine-monophosphate kinase  27.52 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1031  thiamine monophosphate kinase  25.55 
 
 
275 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.7438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2283  thiamine-monophosphate kinase  25.81 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0153463 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.67 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  26.46 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  24.1 
 
 
355 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  26.2 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  23.46 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  22.22 
 
 
317 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  25.4 
 
 
339 aa  64.3  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  23.89 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  21.84 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
314 aa  63.5  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  25.93 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  26.67 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.67 
 
 
758 aa  63.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  23.96 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0031  thiamine-monophosphate kinase  23.01 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  27.04 
 
 
323 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>