More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0031 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0031  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
328 aa  653    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0027  thiamine-monophosphate kinase  68.92 
 
 
331 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00281  putative thiamine-monophosphate kinase  58.59 
 
 
327 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00241  putative thiamine-monophosphate kinase  46.79 
 
 
336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.208498  normal  0.107796 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  44.19 
 
 
327 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  43.43 
 
 
329 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  39.26 
 
 
328 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.259718  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  38.96 
 
 
328 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0024  thiamine-phosphate kinase  40.06 
 
 
328 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 
328 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.554976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  41.94 
 
 
332 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  40.6 
 
 
332 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  42.07 
 
 
329 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  38.89 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  41.37 
 
 
344 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  40.77 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  43.6 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  37.24 
 
 
341 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.08 
 
 
329 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.08 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.76 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.12 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30.87 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30.99 
 
 
344 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  33.55 
 
 
327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  32.07 
 
 
327 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  32.47 
 
 
346 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  26.89 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  31.68 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.3 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  32.48 
 
 
326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  32.48 
 
 
326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.87 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.5 
 
 
337 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.12 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  34.71 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.73 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
326 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
326 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  31.73 
 
 
318 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  31.73 
 
 
318 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
326 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  30.87 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  34.39 
 
 
326 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
329 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  30.87 
 
 
323 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  30.55 
 
 
323 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  32.8 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  31.47 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  32.8 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  32.7 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  30.55 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  30.55 
 
 
318 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  25.76 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.95 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  32.81 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  31.09 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  28.82 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.84 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  30.87 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  33.23 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  30.87 
 
 
358 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  30.52 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  34.78 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  24.93 
 
 
314 aa  109  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  30.43 
 
 
335 aa  109  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  30.63 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  29.97 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  29.88 
 
 
339 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  29.73 
 
 
325 aa  108  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  30.79 
 
 
336 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  30.89 
 
 
321 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  29.49 
 
 
340 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  31.1 
 
 
319 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  30.66 
 
 
334 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  27.3 
 
 
340 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 
337 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.74 
 
 
352 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  32.57 
 
 
332 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  27.15 
 
 
354 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 
315 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  30.45 
 
 
319 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  33.81 
 
 
325 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  28.01 
 
 
363 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  27.54 
 
 
334 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  28.67 
 
 
339 aa  102  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  31.7 
 
 
318 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  36.72 
 
 
329 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  32.91 
 
 
319 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  32.37 
 
 
314 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  29.81 
 
 
338 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>