More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1765 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
539 aa  1085    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.02 
 
 
339 aa  147  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  38.97 
 
 
204 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.41 
 
 
208 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  35.74 
 
 
322 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.69 
 
 
213 aa  139  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.86 
 
 
206 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.89 
 
 
221 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.06 
 
 
204 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  33.76 
 
 
323 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  34.17 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.53 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.38 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.11 
 
 
219 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41 
 
 
204 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  34.24 
 
 
327 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 
217 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.83 
 
 
218 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 
219 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.38 
 
 
324 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
343 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  32.53 
 
 
322 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
211 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.58 
 
 
219 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.1 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  34 
 
 
306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.29 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.55 
 
 
219 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.78 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.78 
 
 
219 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
219 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  37.56 
 
 
209 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
223 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  32.06 
 
 
317 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  30.63 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.38 
 
 
216 aa  127  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.2 
 
 
219 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.92 
 
 
213 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.13 
 
 
210 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 
492 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  33.9 
 
 
323 aa  126  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 
315 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.29 
 
 
219 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  34.32 
 
 
361 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.29 
 
 
219 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.29 
 
 
219 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.45 
 
 
353 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
365 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  31.8 
 
 
338 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  32.63 
 
 
344 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.08 
 
 
211 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
207 aa  123  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 
205 aa  123  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.05 
 
 
215 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
213 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
213 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  33.7 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  32.18 
 
 
336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.61 
 
 
223 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
220 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.77 
 
 
346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.28 
 
 
346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
211 aa  121  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
379 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  40.76 
 
 
217 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.05 
 
 
236 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  34.45 
 
 
346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.64 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
207 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  41.08 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.83 
 
 
224 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.96 
 
 
353 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.33 
 
 
490 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
211 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  34.96 
 
 
340 aa  120  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
206 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  28.84 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.5 
 
 
479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  30.56 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  42.93 
 
 
206 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  30.17 
 
 
352 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  30.55 
 
 
358 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 
206 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.66 
 
 
221 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.51 
 
 
228 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  34.65 
 
 
300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
360 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0487  thiamine monophosphate synthase  40.21 
 
 
212 aa  117  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.97 
 
 
351 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.54 
 
 
210 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  36.31 
 
 
218 aa  117  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  32.9 
 
 
332 aa  116  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
221 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  38.95 
 
 
212 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  28.86 
 
 
305 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.35 
 
 
206 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  30.48 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2443  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.4 
 
 
206 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0164937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>