More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0487 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0487  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.19 
 
 
215 aa  167  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.28 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.28 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1698  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
213 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.5 
 
 
223 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
219 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.62 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.58 
 
 
224 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
219 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.62 
 
 
219 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
219 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.22 
 
 
217 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.06 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
221 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0090  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.75 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.98 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  31.12 
 
 
218 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.9 
 
 
206 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.85 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.2 
 
 
356 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
214 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.2 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.85 
 
 
219 aa  111  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.24 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.74 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.57 
 
 
215 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.55 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  34.69 
 
 
204 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.99 
 
 
207 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.92 
 
 
216 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.99 
 
 
207 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.74 
 
 
218 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
343 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.67 
 
 
204 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2162  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.05 
 
 
210 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  hitchhiker  0.0000728866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.55 
 
 
221 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.25 
 
 
346 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.48 
 
 
211 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.39 
 
 
204 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0030252  normal  0.0171267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.97 
 
 
343 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.16 
 
 
234 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.51 
 
 
236 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.33 
 
 
207 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.23 
 
 
216 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
216 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.77 
 
 
224 aa  101  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.92 
 
 
215 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.37 
 
 
219 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 
206 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  34.48 
 
 
478 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.41 
 
 
347 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.46 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1159  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.99 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0829  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.52 
 
 
213 aa  99  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.982504  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  37.64 
 
 
497 aa  99  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.29 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.93 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0853  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.02 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230824  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2443  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0164937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.16 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
379 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.22 
 
 
197 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.39 
 
 
352 aa  96.3  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.79 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.48 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.69 
 
 
365 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.66 
 
 
222 aa  95.5  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.1 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.91 
 
 
228 aa  95.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.37 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0281488  normal  0.147904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.29 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.85 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  32.98 
 
 
484 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1765  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.21 
 
 
539 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.77 
 
 
219 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2205  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.21 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  33.9 
 
 
484 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.04 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.45 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.64 
 
 
360 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.29 
 
 
343 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.08 
 
 
353 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.2 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.16 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  33.15 
 
 
492 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  32.81 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>