More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1878 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  80.71 
 
 		 482 aa  749    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0968  starch synthase  77.8 
 
 		 482 aa  783    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1878  starch synthase  100 
 
 		 482 aa  980    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1038  starch synthase  75 
 
 		 484 aa  758    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000142829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  34.36 
 
 		 564 aa  303  3.0000000000000004e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1965  Starch synthase  35.08 
 
 		 566 aa  296  7e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00319381  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  27.31 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.31 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.72 
 
 		 587 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.67 
 
 		 478 aa  96.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  29.26 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.66 
 
 		 496 aa  90.5  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  26.18 
 
 		 544 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.1 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.94 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  25.53 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.34 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.86 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  33.6 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.89 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.89 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  34.55 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.89 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  25.53 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  26.27 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.23 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 414 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.73 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.41 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  33.82 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  25.69 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.61 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  34.45 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  25.69 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.29 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  31.39 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.39 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.14 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.96 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  27.02 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.1 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  27.23 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.36 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  26.65 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  33.62 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  30.23 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  27.02 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  26.55 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  27.56 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  27.56 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.69 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  25.11 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  25.44 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.78 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  25.89 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.79 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  25.93 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.21 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  34.05 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  25.79 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  21.4 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  24.73 
 
 		 447 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  25.28 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  31.06 
 
 		 382 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0007  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.482024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  26.07 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.48 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  25.72 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  22.78 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  24.72 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  32.92 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  39.86 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.04 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  32.89 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  23.93 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  21.81 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.48 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.72 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  24.07 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.74 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  24.77 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  25 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  25.33 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  30.85 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  26.41 
 
 		 515 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  24.12 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  22.74 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  25.17 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>