More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0968 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1878  starch synthase  77.8 
 
 		 482 aa  768    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  83.2 
 
 		 482 aa  800    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0968  starch synthase  100 
 
 		 482 aa  982    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1038  starch synthase  74.69 
 
 		 484 aa  779    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000142829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  36.04 
 
 		 564 aa  320  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1965  Starch synthase  36.74 
 
 		 566 aa  317  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00319381  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  29.62 
 
 		 553 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.89 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.52 
 
 		 587 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 425 aa  97.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.25 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.25 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.77 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  29.12 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  29.12 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  28.27 
 
 		 513 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.45 
 
 		 491 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.43 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.19 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  28.51 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.75 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  29.11 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  28.06 
 
 		 513 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  27.22 
 
 		 529 aa  90.9  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.19 
 
 		 488 aa  90.5  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  24.85 
 
 		 484 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 391 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.57 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.72 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  27.1 
 
 		 509 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.43 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  26.33 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  28.21 
 
 		 515 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  26.35 
 
 		 533 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.07 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  26.76 
 
 		 544 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  24.43 
 
 		 519 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.59 
 
 		 481 aa  87.4  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  24.3 
 
 		 519 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  26.69 
 
 		 508 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25 
 
 		 485 aa  86.7  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.39 
 
 		 490 aa  86.7  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  26.38 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0604  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  24.4 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  29.44 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  24.51 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.04 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1380  starch synthase  23.61 
 
 		 523 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0651235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0539  starch synthase  23.59 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  26.97 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  25.89 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.19 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.95 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.17 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.38 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  26.61 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  28.86 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.12 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  28.86 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0299  starch synthase  23.11 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.18 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.8 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  27.17 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  25.6 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  26.13 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  27.16 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.9 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.75 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  30.07 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  25.75 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  26.13 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.23 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  25.87 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.23 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  25.97 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.11 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  25.99 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.17 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.53 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  23.26 
 
 		 484 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.36 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  25.35 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  26.11 
 
 		 469 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.57 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  26.86 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.65 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.62 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.43 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  30.54 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>