More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1308 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  100 
 
 		 482 aa  969    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0968  starch synthase  83.2 
 
 		 482 aa  847    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1878  starch synthase  80.71 
 
 		 482 aa  786    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1038  starch synthase  77.8 
 
 		 484 aa  786    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000142829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  36.55 
 
 		 564 aa  330  3e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1965  Starch synthase  35.55 
 
 		 566 aa  312  9e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00319381  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0792  starch synthase  28.42 
 
 		 553 aa  123  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.6 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.77 
 
 		 587 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.95 
 
 		 490 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  26.11 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  26.11 
 
 		 477 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  27.57 
 
 		 490 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  27.55 
 
 		 477 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.43 
 
 		 486 aa  89.7  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.43 
 
 		 486 aa  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  27.11 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  25.87 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  27.25 
 
 		 529 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  27.11 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  27.35 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.57 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  26.91 
 
 		 483 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  28.67 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  26.68 
 
 		 513 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  27.16 
 
 		 533 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.53 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  27.39 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  25.59 
 
 		 483 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.65 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  26.45 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  26.16 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  31.1 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  26.34 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.99 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  27.11 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.47 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.36 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.52 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  25.97 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.88 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  22.82 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.98 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 391 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  26.13 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.73 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.12 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.71 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.1 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  26.48 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  26.2 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  26.3 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  36.32 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  35.93 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  23.31 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.54 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.6 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.82 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  36.19 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.78 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.93 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.41 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  24.36 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  27.14 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  23.73 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  30.9 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.36 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  34.87 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.6 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  24.94 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.5 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  28.88 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  23.09 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  32.59 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.96 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  25.85 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  25.8 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.8 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.79 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  25.57 
 
 		 414 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  23.37 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  23.9 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  26.74 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.14 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  23.79 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  34.91 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  26.1 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>