101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0132 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0132  SufBD protein  100 
 
 		 369 aa  731    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0125  hypothetical protein  70.41 
 
 		 372 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0190029  hitchhiker  0.00579103 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1169  SufBD protein  65.48 
 
 		 370 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.038096  normal  0.786569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0085  hypothetical protein  65.17 
 
 		 381 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1839  SufBD protein  29.92 
 
 		 375 aa  152  8.999999999999999e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1656  SufBD protein  24.93 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1907  FeS assembly protein SufD  22.13 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  24.32 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  26.38 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  27.38 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  26.92 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  23.61 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  22.15 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  28.66 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1207  SufBD protein  23.53 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.124978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  25.81 
 
 		 470 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  25.27 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  22.3 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  26.57 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  20.42 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  24.52 
 
 		 467 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  25.93 
 
 		 407 aa  50.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  25.48 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  22.42 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  33.85 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.54 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  22.79 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  23.18 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  22.75 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  25.77 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  24.84 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.57 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  39.62 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  36.51 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  22.13 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.79 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  24.11 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  20.33 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  26.74 
 
 		 454 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  21.48 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  34.92 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  21.14 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  23.97 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  24.73 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  24.9 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  22.78 
 
 		 467 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  20.29 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  20.29 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 396 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 396 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  20.9 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  27.6 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  26.19 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  29.03 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_002620  TC0056  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.7 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.61 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  21.15 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  23.3 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  27.2 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  23.14 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  21.43 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  21.43 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  24.78 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00821  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.77 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.795563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.06 
 
 		 483 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  23.51 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  26.32 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  27.2 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  21.43 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0463  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  21.15 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.366005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  21.37 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.54 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  20.64 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  22.92 
 
 		 479 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  27.4 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  22.03 
 
 		 439 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  21.43 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  21.43 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  21.43 
 
 		 430 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  20.71 
 
 		 476 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  21.43 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0075  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.77 
 
 		 480 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  22.58 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  22.58 
 
 		 470 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  21.43 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  21.43 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  29.23 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  21.43 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  22.39 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0415  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  21.83 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0426  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  21.83 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.2 
 
 		 482 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>