272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1839 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1839  SufBD protein  100 
 
 		 375 aa  757    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0125  hypothetical protein  33.8 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0190029  hitchhiker  0.00579103 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0085  hypothetical protein  31.3 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1169  SufBD protein  31.98 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.038096  normal  0.786569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0132  SufBD protein  29.92 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1907  FeS assembly protein SufD  29.28 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1656  SufBD protein  27.57 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  32.72 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  29.45 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  30.86 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  30.86 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  23.56 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  33.33 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  29.19 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  27.49 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  23.36 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  28.57 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0725  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.12 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0056  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.2 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  28.57 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  22.56 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  28.22 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  27.6 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  26.7 
 
 		 489 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  24.64 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  25.16 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  26.14 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  24.26 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  24.65 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1608  FeS assembly protein SufB  26.29 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0033027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  25 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  27.22 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  25 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1207  SufBD protein  23.3 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.124978  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  22.95 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49608  FeS assembly protein suf  27.61 
 
 		 690 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3977  FeS assembly protein SufB  26.14 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229851  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  23.08 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4345  FeS assembly protein SufB  26.14 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.98 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2588  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.86 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386299  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3284  FeS assembly protein SufB  26.75 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1233  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.58 
 
 		 480 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.737377  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  21.94 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  25.53 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.27 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  20.55 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  23.53 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  29.17 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  24.68 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0098  FeS assembly protein SufB  25.71 
 
 		 506 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.782387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2362  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.33 
 
 		 509 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0440  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.33 
 
 		 513 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  24.6 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0195  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.56 
 
 		 493 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3964  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.92 
 
 		 508 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00244471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  23.53 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2094  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.33 
 
 		 509 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0260072  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1242  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.11 
 
 		 506 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  23.73 
 
 		 439 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  25.11 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5848  FeS assembly protein SufB  26.14 
 
 		 489 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  30 
 
 		 420 aa  52.8  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  22.66 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  30.09 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  28.12 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2107  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.71 
 
 		 489 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862611  normal  0.0704835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  24.02 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5109  FeS assembly protein SufB  26.14 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136802 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  27 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2364  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.04 
 
 		 508 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.094709  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.71 
 
 		 489 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  27.81 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  30.19 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  23.49 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2435  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.42 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1631  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.71 
 
 		 503 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190869  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  24.57 
 
 		 490 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  40.68 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0652  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.22 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0636  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.22 
 
 		 482 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  23.49 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  24.54 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  23.49 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  25.41 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.48 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  23.49 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  23.49 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  23.49 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>