More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2551 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 401 aa  802    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  58.15 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  50 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  54.59 
 
 		 407 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  52.96 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  52.78 
 
 		 381 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  54.02 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  50.69 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  51.65 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  52.25 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  51.21 
 
 		 410 aa  362  9e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  52.79 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  52.79 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  50.41 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  49.32 
 
 		 373 aa  356  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  52.33 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  47.71 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  49.73 
 
 		 372 aa  352  7e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  48.74 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  50.96 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  50 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  49.45 
 
 		 399 aa  345  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  48.18 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  49.45 
 
 		 416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  49.59 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  49.86 
 
 		 389 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  48.33 
 
 		 398 aa  341  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  48.06 
 
 		 397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  47.19 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  47.19 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  49.04 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  48.06 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  46.96 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  49.45 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  46.22 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  43.13 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  40.27 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  40.93 
 
 		 411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  29.06 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  27.75 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  35.89 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  31.85 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  30.14 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  27.55 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  28.22 
 
 		 439 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  25.82 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  26.79 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  30.49 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  27.1 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  27.92 
 
 		 467 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  32.33 
 
 		 447 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  30.45 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  25.85 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  28.47 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  29.33 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  29.15 
 
 		 455 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  28.28 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  31.82 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  27.24 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  27.98 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  27.46 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  27.74 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  25.92 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  28.85 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.39 
 
 		 439 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  27.3 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  22.68 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  30.6 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  27.29 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  30.96 
 
 		 441 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  27.08 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  27.3 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  31.53 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  32.06 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  27.51 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  27.38 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  28.47 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  32.76 
 
 		 454 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  25.44 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  31.82 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  31.44 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  29.15 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  30.21 
 
 		 447 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  28.99 
 
 		 441 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.63 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  29.43 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  25.25 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  24.55 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  30.07 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  24.55 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  28.03 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  30.8 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.91 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  29.78 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  28.44 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  25.81 
 
 		 448 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  30.42 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  27.88 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  25.08 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>