More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3082 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  93.72 
 
 		 398 aa  749    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 398 aa  790    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  64.05 
 
 		 389 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  57.41 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  59.66 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  57.03 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  57.95 
 
 		 407 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  57.22 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  55.11 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  55.86 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  55.11 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  55.11 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  55.11 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  57.5 
 
 		 372 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  54.88 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  55.26 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  54.71 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  55.38 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  54.72 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  54.17 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  53.53 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  52.23 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  53.58 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  53.87 
 
 		 412 aa  365  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  54.6 
 
 		 384 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  53.33 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  54.19 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  52.05 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  49.6 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  52.35 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  52.03 
 
 		 410 aa  349  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  51.5 
 
 		 440 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  51.16 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  47.15 
 
 		 386 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  50.4 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  50.41 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  41.64 
 
 		 411 aa  294  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  39.58 
 
 		 415 aa  289  5.0000000000000004e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  40.09 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  40.89 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  26.98 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  27.23 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  29.5 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  33.46 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  28.25 
 
 		 445 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  31.95 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  33.72 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  30.17 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  28.18 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  24.45 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  33.58 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  31.63 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  31.67 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  26.28 
 
 		 441 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  31.65 
 
 		 447 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  31.97 
 
 		 459 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  30.26 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  30.98 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  33.04 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  29.82 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  25.79 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  31.69 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  24.92 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  32.25 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  24.92 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  33.64 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  29.36 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  29.53 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  28.62 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  28.42 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  31.8 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  28.78 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  32.54 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  30.58 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  30.14 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  29.41 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  29.09 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  37.37 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  29.37 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.87 
 
 		 442 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  34.24 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  30.74 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  26.04 
 
 		 442 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  25.45 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  32.43 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  32.43 
 
 		 440 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  23.11 
 
 		 438 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.36 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  36.21 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  31.23 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  28.7 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0561  SufBD protein  34.17 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  28.7 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  28.31 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  28.47 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  33.2 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  32.39 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  27.75 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>