More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2253 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  91.29 
 
 		 425 aa  803    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  91.53 
 
 		 425 aa  804    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 425 aa  864    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  54.8 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  54.33 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  52.8 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  53.65 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  52.58 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  45.5 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  37.59 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  36.61 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  36.73 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  34.62 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  36.95 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  38.11 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  35.14 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  36.62 
 
 		 437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  36.23 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  36.55 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  34.23 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  33.26 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  33.03 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  32.74 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  35.45 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  34.62 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  33.41 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  35.75 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  33.92 
 
 		 430 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  32.44 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  31.84 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 		 447 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  32.94 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  31.2 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  35.43 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  39.55 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  28.47 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  31.02 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  34.91 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  28.6 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.84 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  30.3 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  26.45 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  30.21 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  29.23 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  32.33 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  27.62 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  28.35 
 
 		 426 aa  159  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  31.3 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  29.1 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  30.05 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  38.03 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  27.4 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.42 
 
 		 442 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  34.8 
 
 		 342 aa  157  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  31.54 
 
 		 445 aa  156  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  32.14 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.72 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  26.79 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  30.44 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  30.47 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  29.9 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  27.87 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  28.37 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  29.43 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1626  sufD  34.65 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  29.68 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  26.3 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  28.64 
 
 		 422 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  26.83 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  32.41 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  29.67 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  27.78 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  29.58 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  31.39 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 448 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  26.85 
 
 		 441 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  31.58 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  29.48 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  27.68 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  27.99 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  28.35 
 
 		 430 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  24.94 
 
 		 450 aa  136  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  29.21 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  28.44 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  27.75 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  29.59 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.49 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.76 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  28.84 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  27.59 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.25 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  28.25 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.25 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.25 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  28.25 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  26.79 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  26.79 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>