More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2592 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  100 
 
 		 343 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  44.17 
 
 		 342 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  38.65 
 
 		 399 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  35.24 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  46.05 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  46.08 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  35.31 
 
 		 437 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  44.74 
 
 		 437 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  45.12 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  42.08 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  38.19 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  40.79 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  38.13 
 
 		 439 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  40.08 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  34.33 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  39.62 
 
 		 439 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  40.34 
 
 		 441 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  34.35 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  39.18 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  34.44 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  33.07 
 
 		 425 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  39.34 
 
 		 454 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  34.1 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  34.35 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  32.46 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  32.46 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  37.08 
 
 		 440 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  37.08 
 
 		 440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  34.34 
 
 		 447 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  40.53 
 
 		 447 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  32.98 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  33.07 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  40.25 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  32.36 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  36.23 
 
 		 442 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  33.01 
 
 		 440 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  32.06 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  37.56 
 
 		 440 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  32.66 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  36.68 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  35.02 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  36.24 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.82 
 
 		 439 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  30.11 
 
 		 441 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  36.07 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  31.46 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 423 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  32.88 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  31.33 
 
 		 422 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  31.43 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  25.62 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  37.45 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  28.31 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  46.67 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.31 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  28.31 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.31 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.31 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  32.79 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.05 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  35.12 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  31.27 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.05 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  33.42 
 
 		 448 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.31 
 
 		 423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  26.77 
 
 		 421 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.61 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.61 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  32.24 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.42 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.61 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  29.59 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  27.34 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.9 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.61 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  29.59 
 
 		 428 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.35 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  31.27 
 
 		 427 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  31.67 
 
 		 448 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  35.11 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  30.3 
 
 		 433 aa  129  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  32.06 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  30.42 
 
 		 454 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  31.02 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  31.71 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  25.58 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  27.91 
 
 		 430 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  41.88 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  28.83 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  28.96 
 
 		 467 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1626  sufD  29.09 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  30.85 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  35.11 
 
 		 430 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 		 455 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 		 455 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.35 
 
 		 453 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  31.12 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  33.72 
 
 		 448 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  29.6 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>