More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0242 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  913    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  38.69 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  38.02 
 
 
439 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  35.7 
 
 
444 aa  292  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  36.57 
 
 
436 aa  279  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  35.94 
 
 
425 aa  275  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  37.09 
 
 
438 aa  269  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  36.72 
 
 
437 aa  266  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  34.31 
 
 
446 aa  256  6e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  35.07 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  37.28 
 
 
433 aa  249  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  37.19 
 
 
439 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  32.4 
 
 
447 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  33.57 
 
 
428 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  33.41 
 
 
426 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  33.17 
 
 
426 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 
447 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  32.85 
 
 
428 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  31.85 
 
 
475 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  31.76 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  31.09 
 
 
437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  33.23 
 
 
439 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  31.62 
 
 
437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  32.67 
 
 
440 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  30.9 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  31.85 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  30.17 
 
 
445 aa  212  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  29.67 
 
 
467 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  31.46 
 
 
453 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  33.09 
 
 
448 aa  203  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  28.99 
 
 
441 aa  203  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  29.83 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  29.7 
 
 
437 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  27.9 
 
 
454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  29.68 
 
 
454 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.68 
 
 
442 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  29.93 
 
 
434 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  28.47 
 
 
444 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  31.05 
 
 
451 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  29.98 
 
 
428 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.62 
 
 
453 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  31.74 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  29.73 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  31.11 
 
 
439 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  30.36 
 
 
437 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  29.76 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  29.57 
 
 
424 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  28.71 
 
 
435 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  35.97 
 
 
399 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  28.15 
 
 
419 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.61 
 
 
441 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  35.49 
 
 
455 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  35.49 
 
 
455 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  29.5 
 
 
437 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  28.88 
 
 
445 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  28.86 
 
 
459 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  27.71 
 
 
424 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  27.18 
 
 
446 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  26.11 
 
 
446 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  27.32 
 
 
418 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.79 
 
 
440 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  28.44 
 
 
444 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  29.36 
 
 
440 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.7 
 
 
448 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  28.71 
 
 
439 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  28.78 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  27.64 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  28.35 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  28.54 
 
 
425 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 
430 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  27.88 
 
 
439 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  28.86 
 
 
430 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  25.91 
 
 
424 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.03 
 
 
448 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  29.56 
 
 
420 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  26.58 
 
 
440 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  29.69 
 
 
450 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  27.4 
 
 
425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.54 
 
 
441 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  33.44 
 
 
426 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.54 
 
 
441 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  26.44 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 
434 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  27.25 
 
 
421 aa  144  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  27.39 
 
 
430 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  24.49 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  24.94 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  25.25 
 
 
440 aa  141  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  25.57 
 
 
427 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.8 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.88 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  35.12 
 
 
343 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.53 
 
 
423 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  29.24 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.53 
 
 
423 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  28.29 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  26.12 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.27 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.45 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>