More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1005 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
435 aa  882    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  61.52 
 
 
444 aa  579  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  43.81 
 
 
450 aa  339  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  43.57 
 
 
453 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  39.32 
 
 
434 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  37.06 
 
 
445 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  32.32 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  33.41 
 
 
420 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  32.33 
 
 
404 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  31.67 
 
 
441 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  32.15 
 
 
445 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  33.49 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  28.91 
 
 
466 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  33.17 
 
 
446 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  30.82 
 
 
430 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  32.95 
 
 
405 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  28.14 
 
 
467 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 
437 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  27.87 
 
 
470 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  29.45 
 
 
430 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  29.45 
 
 
430 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  29.45 
 
 
430 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  29.45 
 
 
430 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  29.45 
 
 
430 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  31.51 
 
 
453 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  29.45 
 
 
430 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  29.22 
 
 
430 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  30.32 
 
 
469 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  29.12 
 
 
430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  29.22 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  29.22 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  30.86 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 
436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.54 
 
 
487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 
480 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  28.07 
 
 
487 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  30.73 
 
 
425 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  27.7 
 
 
479 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  29.33 
 
 
439 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  29.4 
 
 
467 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.44 
 
 
490 aa  179  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 
442 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  32.45 
 
 
423 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  28.73 
 
 
436 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  28.71 
 
 
439 aa  178  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  36.66 
 
 
437 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  30.79 
 
 
444 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  36.5 
 
 
437 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  25.94 
 
 
470 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  32.44 
 
 
451 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 
469 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  30.71 
 
 
441 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  28.84 
 
 
468 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 
470 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  29 
 
 
428 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  36.66 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  28.71 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.48 
 
 
470 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  29.57 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.06 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  31.49 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  29.32 
 
 
428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.53 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  34.38 
 
 
437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  30.45 
 
 
445 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  26.54 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  26.21 
 
 
475 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  35.96 
 
 
389 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 
485 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  27.98 
 
 
473 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.52 
 
 
439 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 
470 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  28.28 
 
 
406 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  28.07 
 
 
466 aa  172  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.59 
 
 
482 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 
477 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  27.15 
 
 
472 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  27.02 
 
 
465 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.54 
 
 
483 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  34.06 
 
 
454 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  26.17 
 
 
471 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  30.23 
 
 
439 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  26.28 
 
 
472 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  26.09 
 
 
479 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  26.12 
 
 
479 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  24.76 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  26.45 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  25.35 
 
 
465 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  25.47 
 
 
472 aa  167  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  26.32 
 
 
487 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  26.32 
 
 
487 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  26.32 
 
 
487 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  30.62 
 
 
454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.51 
 
 
472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  27.08 
 
 
408 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  25.12 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  25.12 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  25.12 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>