More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4459 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  93.41 
 
 		 440 aa  832    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  82.27 
 
 		 440 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 440 aa  881    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  93.64 
 
 		 440 aa  835    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  72.67 
 
 		 439 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  69.93 
 
 		 439 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  47.03 
 
 		 446 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  43.91 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  43.41 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  45.14 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  42.75 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  42.08 
 
 		 444 aa  293  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  43.28 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  41.85 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  41.44 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  41.67 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  43.52 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  39.52 
 
 		 437 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  39.85 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  39.42 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  38.33 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  33.94 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  33.72 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  33.49 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  33.76 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  36.78 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  35.98 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  37.47 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  37.73 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  37.47 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  36.6 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  33.25 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  34.38 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  35.93 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  32.11 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  32.67 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  35.29 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  34.72 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  34.13 
 
 		 427 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.42 
 
 		 439 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  28.39 
 
 		 438 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.44 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  29.95 
 
 		 475 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  29.29 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  32.23 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  29.2 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  29.46 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  30.49 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  34.62 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  32.65 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  35.8 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  33.49 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  31.5 
 
 		 445 aa  180  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1626  sufD  32.52 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443555 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  30.75 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  34.07 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  34.09 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  31.36 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  31.6 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  30.56 
 
 		 448 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  26.97 
 
 		 437 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  28.86 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  27.94 
 
 		 441 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  31.22 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  39.18 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  30.07 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  30.07 
 
 		 454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  29.95 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  26.85 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  30.52 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  30.31 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  30.31 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.15 
 
 		 448 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  27.6 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  31.86 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.31 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  28.71 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  29.12 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  28.61 
 
 		 439 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  24.49 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  27.42 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  34.91 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.46 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.19 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  29.23 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.12 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.85 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  27.74 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  29.84 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.05 
 
 		 423 aa  133  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  28.92 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.77 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>