More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2571 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 447 aa  881    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  38.21 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  41.15 
 
 		 439 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  35.42 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  35.56 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  40.62 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  40.29 
 
 		 437 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  38.59 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  35.68 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  38.6 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  40 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  39.57 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  38.16 
 
 		 447 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  37.96 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  37.65 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  37.03 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  34.69 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  37.56 
 
 		 459 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  39.29 
 
 		 437 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  39.47 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  35.66 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  35.8 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  35.46 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  39.31 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  34.7 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  32.6 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  41.03 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  36.57 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  30.35 
 
 		 437 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  39.02 
 
 		 440 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  38.59 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  38.42 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  38.59 
 
 		 440 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  39.27 
 
 		 440 aa  237  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  37.03 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.83 
 
 		 439 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  38.01 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  38.97 
 
 		 441 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  29.38 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  33.17 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  34.54 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  39.27 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  40.2 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  35.5 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  32.84 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  33.42 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  31.01 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  34.91 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  40 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  32.75 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  35.1 
 
 		 454 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  31.55 
 
 		 448 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  37.75 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  32.03 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  31.77 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  32.18 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  32.82 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  37.82 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  36.79 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1626  sufD  34.83 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  34.26 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  31.11 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  31.11 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  32.77 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.79 
 
 		 442 aa  192  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  34.18 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  33.75 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  31.89 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  36.59 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  33.82 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  32.53 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.93 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.5 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  36.27 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.76 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  33.97 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  33.25 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  32.51 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  31.45 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  31.62 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  35.36 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.42 
 
 		 441 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  30.81 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  35.11 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.08 
 
 		 434 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  35.44 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.13 
 
 		 423 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.25 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.25 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.75 
 
 		 423 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  32.29 
 
 		 424 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  28.4 
 
 		 418 aa  169  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.75 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  26.54 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.75 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  30.23 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  31.25 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>