More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4357 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 453 aa  938    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  54.7 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  53.53 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  51.01 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  51.01 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  49.04 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  52.87 
 
 		 448 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  44.98 
 
 		 440 aa  333  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  42.04 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  42.96 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  37.41 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  35.25 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  33.98 
 
 		 445 aa  262  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  33.41 
 
 		 437 aa  256  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  32.87 
 
 		 438 aa  256  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  34.82 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  34.57 
 
 		 426 aa  247  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  34.34 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  36.21 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  35.89 
 
 		 433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  31.28 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  36.32 
 
 		 439 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  36.18 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  35.8 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  32.94 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  33.09 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  33.25 
 
 		 428 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  31.31 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  31.5 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.79 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  34.82 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  30.58 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  33.66 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  32.69 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  32.75 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  31.46 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  32.13 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  32.65 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  30.05 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.02 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.77 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  32.69 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  29.56 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.99 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  29.87 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.82 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  30.55 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  31.51 
 
 		 435 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  31.06 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  31.05 
 
 		 467 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  31.47 
 
 		 422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  30.57 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  28.22 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  29.41 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0406  ABC transporter, membrane component  32.09 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.449797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  27.87 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  30.29 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  31.39 
 
 		 440 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  31.22 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  30.41 
 
 		 441 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.99 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  29.22 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  29.35 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  31.36 
 
 		 420 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01351  ABC transporter, membrane component  30.47 
 
 		 412 aa  173  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.228758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1434  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly permease component  30.07 
 
 		 412 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.56656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.87 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  27.43 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00791  ABC transporter, membrane component  28.89 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.917338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  27.07 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.79 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.55 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.55 
 
 		 423 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  30.05 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2280  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  41.28 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.69897  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  28.94 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  28.08 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  30.9 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.12 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  25.85 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.88 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.66 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.9 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.66 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00801  ABC transporter, membrane component  35.81 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  30.41 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.41 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  30.41 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.41 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.41 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  28.32 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  27.88 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  26.13 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  28.5 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  38.05 
 
 		 416 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  25.98 
 
 		 424 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  28.66 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>