More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_11500 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  100 
 
 
412 aa  828    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  57.22 
 
 
399 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  57.49 
 
 
407 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  53.51 
 
 
407 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  56.52 
 
 
398 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  55.56 
 
 
399 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  55.26 
 
 
397 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  53.97 
 
 
393 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  52.08 
 
 
417 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  54.02 
 
 
416 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  56.02 
 
 
390 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  54.86 
 
 
389 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  51.26 
 
 
413 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  54.67 
 
 
398 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  52.05 
 
 
372 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  53.07 
 
 
434 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  52.53 
 
 
397 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  53.87 
 
 
398 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  54.42 
 
 
372 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  53.11 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  53.11 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  53.53 
 
 
389 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  52.47 
 
 
384 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  51.7 
 
 
399 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  51.56 
 
 
392 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  49.76 
 
 
429 aa  358  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  51.38 
 
 
373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  48.41 
 
 
440 aa  352  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  49.06 
 
 
407 aa  333  5e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  49.17 
 
 
405 aa  322  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  48.23 
 
 
410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  49.45 
 
 
401 aa  315  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  46.28 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  47.1 
 
 
419 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  46.42 
 
 
381 aa  308  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  42.38 
 
 
411 aa  305  7e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  41.11 
 
 
415 aa  301  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  45.64 
 
 
440 aa  295  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  29.6 
 
 
434 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  36.53 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  32.08 
 
 
441 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  26.78 
 
 
425 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  34.45 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 
437 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  32.42 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  26.33 
 
 
438 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  24.21 
 
 
439 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  31.02 
 
 
447 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  32.26 
 
 
437 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  31.82 
 
 
439 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  36.04 
 
 
444 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  30.65 
 
 
437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  26.73 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  31.63 
 
 
444 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  29.06 
 
 
445 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  35.48 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  32.81 
 
 
454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  29.55 
 
 
450 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  31.23 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  32.26 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  31.44 
 
 
455 aa  116  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  27.76 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  28.94 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  30.72 
 
 
437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  26.79 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  29.44 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  29.36 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  29.11 
 
 
467 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  30.35 
 
 
436 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  28.94 
 
 
428 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  29.78 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  33.97 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  32.78 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  30.04 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  33.66 
 
 
440 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  25.89 
 
 
451 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 
470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  33.65 
 
 
440 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  29.73 
 
 
446 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  33.47 
 
 
434 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  30.39 
 
 
437 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  31.1 
 
 
440 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  31.37 
 
 
437 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  31.64 
 
 
437 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  28.42 
 
 
448 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  25.65 
 
 
433 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  33.89 
 
 
459 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  26.76 
 
 
404 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  29.48 
 
 
426 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  25.62 
 
 
428 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  28.17 
 
 
427 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  33.51 
 
 
441 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  29.48 
 
 
426 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  29.31 
 
 
396 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.5 
 
 
439 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  26.92 
 
 
426 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  31.5 
 
 
467 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  32.67 
 
 
475 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  28.74 
 
 
444 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  31.46 
 
 
405 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>