More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0605 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  100 
 
 		 411 aa  839    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  67.57 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  48.21 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  46.72 
 
 		 399 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  44.9 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  43.6 
 
 		 407 aa  318  9e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  42.82 
 
 		 429 aa  305  7e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  42.38 
 
 		 412 aa  305  7e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  45.15 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  43.41 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  42.9 
 
 		 372 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  41.67 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  44.63 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  42.44 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  43.24 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  40.62 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  41.64 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  43.88 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  43.09 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  43.09 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  42.13 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  43.36 
 
 		 392 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  41.5 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  40.97 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  43.01 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  43.01 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  42.7 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  41.69 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  41.5 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  40.75 
 
 		 373 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  41.32 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  41.22 
 
 		 440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  40.93 
 
 		 401 aa  282  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  39.47 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  42.78 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  40.06 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  38.37 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  37.91 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  35.81 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  28.4 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  26.8 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  30.73 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  29.68 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  31.46 
 
 		 454 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  30 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  25.44 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  33.17 
 
 		 446 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  26.38 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  31.48 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  25.57 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  26.08 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  28.46 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  27.82 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  27.82 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  28.52 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  31.36 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  29.68 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  25.82 
 
 		 442 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  23.15 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  27.54 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  29.26 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  26.52 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  32.5 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  30.52 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  24.61 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  29.95 
 
 		 447 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  27.76 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  34.43 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  22.55 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  31.22 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  31.63 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  24.69 
 
 		 439 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  27.66 
 
 		 445 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  26.8 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  26.64 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  27.65 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.84 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0561  SufBD protein  36.47 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.09 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  25.57 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  31.66 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  26.84 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  27.09 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.21 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  26.84 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.21 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.77 
 
 		 423 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  22.83 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.77 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  26.68 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.77 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.84 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2592  SufBD protein  29.28 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.956009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.77 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  25.7 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  27.6 
 
 		 440 aa  103  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.52 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  29.01 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>