More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5153 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 390 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  72.01 
 
 		 389 aa  541  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  70.48 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  67.83 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  66.4 
 
 		 392 aa  494  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  65.45 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  67.51 
 
 		 372 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  65.95 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  65.95 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  64.86 
 
 		 397 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  65.42 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  65.29 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  63.71 
 
 		 372 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  63.97 
 
 		 373 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  60.2 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  61.44 
 
 		 417 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  61.24 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  59.95 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  60.74 
 
 		 384 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  58.54 
 
 		 407 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  60.74 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  59.73 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  59.84 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  56.65 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  59.26 
 
 		 381 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  58.97 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  55.05 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  57.99 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  57.87 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  56.23 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  55.3 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  54.45 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  54.83 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  55.86 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  52.06 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  52.33 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  44.74 
 
 		 411 aa  308  8e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  41.67 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  33.45 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  41.1 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  33.68 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  31.94 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  34.68 
 
 		 450 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  26.97 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  27.55 
 
 		 444 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  34.51 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  34.96 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  30.18 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  29.93 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 		 439 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  32.57 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  34.76 
 
 		 441 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  32.82 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  32.24 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  36.24 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  36.52 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  33.78 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  24.6 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  25.07 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  34.41 
 
 		 441 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  32.75 
 
 		 467 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  25.07 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  33.18 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  32.42 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  34.84 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  32.51 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  34.1 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  31.8 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  32.59 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  30.87 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  30.88 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  32.11 
 
 		 447 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  30.43 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  29.64 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  31.74 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  29.96 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  31.65 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  28.94 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  32.87 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  32.74 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  32.61 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0561  SufBD protein  28.12 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  32.87 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.78 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  28.08 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  26.4 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  31.47 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  32.08 
 
 		 446 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  30.91 
 
 		 475 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  32.8 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  26.15 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  32.16 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  31.49 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  27.73 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>