More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0709 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 405 aa  828    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  93.09 
 
 		 405 aa  781    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  56.97 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  42.71 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  31.13 
 
 		 455 aa  219  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  30.82 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.3 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  31.14 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 		 485 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.05 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  29.59 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.86 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  32.17 
 
 		 488 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.57 
 
 		 483 aa  196  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  33.65 
 
 		 436 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  31.35 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.57 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 		 479 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  32.95 
 
 		 435 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  26.53 
 
 		 470 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  28.88 
 
 		 470 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.61 
 
 		 470 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  26.95 
 
 		 464 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.68 
 
 		 482 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 		 487 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  28.33 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 		 487 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 		 487 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  29.75 
 
 		 476 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  32.55 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  26.25 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  28.33 
 
 		 470 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  26.95 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 476 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.1 
 
 		 470 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.92 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  27.14 
 
 		 469 aa  189  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.54 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  33.01 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.92 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.58 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.64 
 
 		 475 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  28.1 
 
 		 481 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 470 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 485 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.64 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  27.93 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.95 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  26.71 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 		 481 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  27.45 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  29.02 
 
 		 468 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.9 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  28.75 
 
 		 476 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  26.73 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  27.92 
 
 		 465 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  27.92 
 
 		 465 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  25.91 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  30.89 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.21 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  27.68 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  30.54 
 
 		 430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  27.68 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  27.68 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  31.53 
 
 		 465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  27.45 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  28.65 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  30.32 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  26.73 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.37 
 
 		 482 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  29 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  26.54 
 
 		 471 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  30.32 
 
 		 430 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  28.16 
 
 		 465 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  28.93 
 
 		 478 aa  179  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  26.01 
 
 		 465 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 		 471 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  29.52 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  26.01 
 
 		 465 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  30.32 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  30.32 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  30.32 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 466 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  30.32 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  26.56 
 
 		 469 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  26.25 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  27.86 
 
 		 552 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  30.32 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>