More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5154 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  63.18 
 
 		 465 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  65 
 
 		 463 aa  653    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  86.36 
 
 		 470 aa  845    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  67.52 
 
 		 469 aa  684    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  63.18 
 
 		 465 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  83.16 
 
 		 481 aa  852    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  64.72 
 
 		 465 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  85.81 
 
 		 476 aa  863    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  82.03 
 
 		 483 aa  806    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  64.72 
 
 		 465 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  65.04 
 
 		 477 aa  650    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  64.94 
 
 		 465 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  64.94 
 
 		 465 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  63.18 
 
 		 465 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  88.46 
 
 		 485 aa  885    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  100 
 
 		 481 aa  1000    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  86.72 
 
 		 470 aa  853    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  86.28 
 
 		 481 aa  887    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  86.35 
 
 		 476 aa  866    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  64.94 
 
 		 465 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  87.88 
 
 		 470 aa  844    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  64.72 
 
 		 465 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  82.25 
 
 		 487 aa  849    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  83.99 
 
 		 482 aa  834    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  82.74 
 
 		 475 aa  807    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  64.72 
 
 		 465 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  81.41 
 
 		 490 aa  824    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  85.26 
 
 		 470 aa  852    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  66.23 
 
 		 472 aa  657    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  72.69 
 
 		 552 aa  731    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  82.87 
 
 		 470 aa  826    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  70.11 
 
 		 499 aa  717    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  65.95 
 
 		 465 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  64.72 
 
 		 465 aa  656    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  81.8 
 
 		 470 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  85.28 
 
 		 478 aa  824    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  65.37 
 
 		 465 aa  661    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  62.39 
 
 		 467 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  67.1 
 
 		 465 aa  672    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  89.13 
 
 		 485 aa  892    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  86.04 
 
 		 487 aa  881    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  65.92 
 
 		 471 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  64.12 
 
 		 470 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  66.67 
 
 		 465 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  86.34 
 
 		 479 aa  867    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  67.19 
 
 		 466 aa  656    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  85.56 
 
 		 480 aa  871    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  81.34 
 
 		 487 aa  841    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  88.68 
 
 		 479 aa  886    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  85.19 
 
 		 470 aa  839    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  86.05 
 
 		 477 aa  842    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  85.12 
 
 		 485 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  86.36 
 
 		 472 aa  853    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  86.04 
 
 		 487 aa  881    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  88.46 
 
 		 479 aa  884    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  65.99 
 
 		 471 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  83.55 
 
 		 470 aa  827    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  64.72 
 
 		 465 aa  655    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  86.51 
 
 		 470 aa  844    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  66.09 
 
 		 473 aa  659    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  83.58 
 
 		 479 aa  845    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  86.04 
 
 		 487 aa  881    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  87.97 
 
 		 482 aa  898    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  64.8 
 
 		 471 aa  634  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  63.18 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  63.56 
 
 		 466 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  62.75 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  61.64 
 
 		 468 aa  623  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  59.48 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  59.1 
 
 		 470 aa  588  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  60.31 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  58.67 
 
 		 476 aa  567  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  56.31 
 
 		 470 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  59.45 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  55.2 
 
 		 467 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  56.53 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  55.23 
 
 		 475 aa  522  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  54.07 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  52.52 
 
 		 475 aa  511  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  53.25 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  49.49 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  52.93 
 
 		 476 aa  502  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  49.24 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  53.2 
 
 		 476 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  51.21 
 
 		 470 aa  498  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  49.02 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  52.93 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  52.06 
 
 		 476 aa  497  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  51.48 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  51.03 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  49.01 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  48.41 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  49.1 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  48.52 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  46.82 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  84.65 
 
 		 846 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  46.5 
 
 		 479 aa  435  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  45.37 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  43.91 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  42.68 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>