More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0497 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  86.9 
 
 		 435 aa  787    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 435 aa  891    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  86.9 
 
 		 435 aa  787    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  54.92 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  54.23 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  54.23 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  54.02 
 
 		 437 aa  461  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  54 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  54 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  54.23 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  54 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  54.23 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  54.23 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  54 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  54 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  53.1 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  39.53 
 
 		 420 aa  315  8e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  37.18 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  37.33 
 
 		 420 aa  292  7e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  36.36 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  35.02 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  34.83 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  30.5 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  30.63 
 
 		 408 aa  202  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  30.16 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  27.44 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 		 476 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  30.86 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  25.83 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  30.59 
 
 		 404 aa  193  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  27.46 
 
 		 476 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.98 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  30.37 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  30.16 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  26.81 
 
 		 475 aa  190  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 477 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 		 476 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  27.46 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  28.9 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  28.94 
 
 		 485 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.77 
 
 		 470 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  26.64 
 
 		 464 aa  186  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.77 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  29.67 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  26.42 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.54 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 		 479 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  29.5 
 
 		 472 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  29.61 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.34 
 
 		 476 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.1 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  28.78 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  28.01 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.76 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  28.3 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.77 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  28.24 
 
 		 470 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  29 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  30.27 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.24 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.5 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.53 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  26.76 
 
 		 471 aa  176  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  27.76 
 
 		 485 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  25.51 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.3 
 
 		 482 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  26.68 
 
 		 470 aa  176  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.91 
 
 		 470 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  27.19 
 
 		 404 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.51 
 
 		 483 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  27.83 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  25.53 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.04 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.53 
 
 		 485 aa  173  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 		 479 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  26.17 
 
 		 470 aa  172  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  26.82 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  27.04 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  26.15 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  26.76 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 470 aa  170  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  24.76 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  26 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  25.74 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  25.81 
 
 		 478 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.24 
 
 		 482 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.6 
 
 		 472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  25.6 
 
 		 468 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  25.58 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  26.3 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.66 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  26.48 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  26.48 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  25.91 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>