More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3073 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  85.13 
 
 		 437 aa  756    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 436 aa  890    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  66.36 
 
 		 430 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  66.05 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  65.81 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  66.05 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  66.05 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  66.05 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  65.58 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  65.81 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  65.58 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  66.05 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  66.05 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  53.49 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  53.49 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  53.1 
 
 		 435 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  43.78 
 
 		 429 aa  353  5e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  41.82 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  42.06 
 
 		 420 aa  330  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  39.67 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  36.01 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  35.42 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  33.98 
 
 		 426 aa  229  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  32.15 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  30.02 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.98 
 
 		 470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  30.33 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  30.25 
 
 		 485 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.02 
 
 		 490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  30.67 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.5 
 
 		 476 aa  216  8e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.53 
 
 		 470 aa  216  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  31.05 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  28.15 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  30.21 
 
 		 479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  29.5 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  29.56 
 
 		 476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.64 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  31.36 
 
 		 476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  30.22 
 
 		 464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  30.43 
 
 		 470 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.13 
 
 		 483 aa  212  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.33 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  29.29 
 
 		 487 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.82 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  33.1 
 
 		 434 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  29.29 
 
 		 470 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  29.33 
 
 		 470 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.05 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  28.41 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  29.33 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  29.33 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  33.65 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  29.75 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.83 
 
 		 476 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.52 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  28.18 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  29.56 
 
 		 477 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  29.29 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  30.07 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.97 
 
 		 487 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.02 
 
 		 475 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  33.65 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  30.72 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.86 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  28.6 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 		 471 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.94 
 
 		 481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  27.03 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  27.03 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  28.09 
 
 		 463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  27.55 
 
 		 467 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  27.02 
 
 		 470 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  27.49 
 
 		 465 aa  196  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  30.59 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 		 471 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  27.91 
 
 		 471 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.69 
 
 		 482 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 		 485 aa  192  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.61 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.02 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.46 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  30.75 
 
 		 455 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  27.97 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  27.82 
 
 		 499 aa  190  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  26.56 
 
 		 477 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  27.52 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  27.31 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  27.75 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  26.46 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  25.47 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>