More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0219 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  78.33 
 
 
420 aa  699    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  855    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  64.01 
 
 
418 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  42.89 
 
 
429 aa  365  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  43.31 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  43.07 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  43.31 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  43.31 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  43.31 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  43.31 
 
 
430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  43.07 
 
 
430 aa  336  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  43.07 
 
 
430 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  43.07 
 
 
430 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  42.82 
 
 
430 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  42.96 
 
 
430 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  41.76 
 
 
437 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  42.06 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  42.16 
 
 
394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  37.91 
 
 
435 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  37.91 
 
 
435 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  37.33 
 
 
435 aa  292  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  34.07 
 
 
426 aa  241  2e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  29.51 
 
 
434 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  30.42 
 
 
423 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  28.15 
 
 
444 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  25.12 
 
 
477 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  26.42 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  24.94 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  25.23 
 
 
479 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  27.14 
 
 
403 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  22.8 
 
 
467 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  24.94 
 
 
465 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  27.65 
 
 
435 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  28.16 
 
 
404 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  25.23 
 
 
479 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  25.18 
 
 
469 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  27.19 
 
 
406 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  25.73 
 
 
471 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 
487 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.13 
 
 
470 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  24.07 
 
 
470 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  26.04 
 
 
476 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  26.38 
 
 
475 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  23.46 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  27.73 
 
 
405 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  25.12 
 
 
487 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.47 
 
 
470 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  25.35 
 
 
487 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  27.16 
 
 
403 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.54 
 
 
404 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.41 
 
 
470 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  25.35 
 
 
487 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.72 
 
 
490 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  26.78 
 
 
408 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  25.35 
 
 
487 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  26.97 
 
 
485 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  24.47 
 
 
469 aa  154  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  25.36 
 
 
499 aa  153  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 
396 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  27.67 
 
 
450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  22.8 
 
 
472 aa  152  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  26.67 
 
 
485 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 
475 aa  152  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  26.65 
 
 
405 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.31 
 
 
453 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 
469 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  24.7 
 
 
472 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  25.85 
 
 
476 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  25.12 
 
 
552 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  25.61 
 
 
471 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.06 
 
 
482 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  25.61 
 
 
471 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  23.32 
 
 
465 aa  150  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  24.17 
 
 
472 aa  150  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  23.71 
 
 
481 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  27.75 
 
 
466 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  24.77 
 
 
480 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  22.77 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  26.96 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  26.69 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  24.77 
 
 
455 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  23.72 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  24.29 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  25.69 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  22.3 
 
 
468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  26.57 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  24.1 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  24.1 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  24.05 
 
 
476 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  25.06 
 
 
479 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.03 
 
 
483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  25.61 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  25.49 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  23.56 
 
 
476 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  23.47 
 
 
485 aa  147  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
479 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  24.46 
 
 
472 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  23.72 
 
 
476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  24.64 
 
 
465 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>