More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0378 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  100 
 
 		 403 aa  810    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  83.38 
 
 		 403 aa  657    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  74.94 
 
 		 406 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  75.19 
 
 		 408 aa  606  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  66.5 
 
 		 404 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  30.18 
 
 		 466 aa  206  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  30.28 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  31.17 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.38 
 
 		 483 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.77 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.68 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 		 434 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  30.73 
 
 		 476 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.74 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  30.86 
 
 		 435 aa  195  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  29.81 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  30.48 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  29.89 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  30.38 
 
 		 465 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  29.51 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  29.22 
 
 		 481 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  29.22 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  29.22 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  29.95 
 
 		 470 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  30.44 
 
 		 485 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 		 479 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  30 
 
 		 476 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  31.02 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  29.95 
 
 		 485 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  29.66 
 
 		 470 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  29.2 
 
 		 485 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  28.74 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  29.43 
 
 		 470 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.67 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.41 
 
 		 487 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  28.89 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  30.52 
 
 		 470 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.14 
 
 		 490 aa  186  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.34 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  29.11 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  26.76 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  29.04 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  29.76 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  31 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  27.83 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 		 466 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  27.59 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  27.59 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 		 465 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  27.61 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  29.04 
 
 		 470 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  27.59 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  27.36 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  27.36 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.11 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  28.4 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.64 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  29.41 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  28.31 
 
 		 481 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  27.36 
 
 		 465 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  29.52 
 
 		 418 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  29.31 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  28.17 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  28.5 
 
 		 465 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  28.87 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  29.2 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  27.48 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  28.71 
 
 		 420 aa  176  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  27.12 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  28.88 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  29.07 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  31.36 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.65 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  29.66 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  28.84 
 
 		 471 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.72 
 
 		 475 aa  173  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.8 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.57 
 
 		 468 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  27.46 
 
 		 470 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  29.84 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  29.92 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  26.42 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  27.21 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  26.42 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  25.81 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0426  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.68 
 
 		 480 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  27.93 
 
 		 469 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3284  FeS assembly protein SufB  28.24 
 
 		 479 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0415  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.68 
 
 		 480 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>