More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2390 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  67.03 
 
 
470 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  67.1 
 
 
465 aa  659    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  68.63 
 
 
465 aa  679    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  68.63 
 
 
465 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  63.91 
 
 
470 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  68.63 
 
 
465 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  66.67 
 
 
465 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  68.41 
 
 
465 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  68.41 
 
 
465 aa  678    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  68.85 
 
 
465 aa  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  67.73 
 
 
470 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  65.73 
 
 
470 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  68.49 
 
 
463 aa  675    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  63.91 
 
 
485 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  65.43 
 
 
481 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  63.97 
 
 
471 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  68.63 
 
 
465 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  63.4 
 
 
471 aa  635    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  65.51 
 
 
476 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  66.09 
 
 
483 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  63.91 
 
 
552 aa  637    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  65.94 
 
 
470 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  67.03 
 
 
466 aa  681    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  68.85 
 
 
465 aa  680    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  64.57 
 
 
490 aa  642    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  72.59 
 
 
469 aa  711    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  67.39 
 
 
479 aa  670    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  66.81 
 
 
478 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  71.12 
 
 
465 aa  692    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  65.07 
 
 
468 aa  639    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  67.4 
 
 
467 aa  658    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  68.19 
 
 
465 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  65.38 
 
 
481 aa  658    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  64.78 
 
 
487 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  64.18 
 
 
471 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  68.02 
 
 
470 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  66.81 
 
 
470 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  66.52 
 
 
479 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  68.19 
 
 
465 aa  677    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  68.41 
 
 
465 aa  678    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  65.87 
 
 
485 aa  656    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  65.65 
 
 
476 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  64.21 
 
 
487 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  100 
 
 
473 aa  988    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  68.26 
 
 
470 aa  670    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  65.29 
 
 
470 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  64.86 
 
 
487 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  65.94 
 
 
472 aa  658    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  66.09 
 
 
482 aa  658    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  64.78 
 
 
487 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  65 
 
 
479 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  65.65 
 
 
485 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  65.73 
 
 
470 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  66.67 
 
 
465 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  65.96 
 
 
472 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  68.85 
 
 
465 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  67.98 
 
 
477 aa  664    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  66.09 
 
 
482 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  65.87 
 
 
479 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  67.39 
 
 
480 aa  667    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  63.91 
 
 
499 aa  637    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  64.78 
 
 
487 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  66.09 
 
 
481 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  64.15 
 
 
466 aa  631  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  65.38 
 
 
475 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  65.5 
 
 
477 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  62.69 
 
 
472 aa  622  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  60.25 
 
 
469 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  60.13 
 
 
469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  60.09 
 
 
472 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  60.61 
 
 
470 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  59.96 
 
 
462 aa  560  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  58.02 
 
 
476 aa  558  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  54.33 
 
 
467 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  53.35 
 
 
486 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  52.81 
 
 
470 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  55.11 
 
 
475 aa  518  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  51.95 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  52.45 
 
 
471 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  54.08 
 
 
476 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  53.96 
 
 
476 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  54 
 
 
475 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  51.24 
 
 
464 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  51.69 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  53.33 
 
 
476 aa  491  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  49.46 
 
 
471 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  51.02 
 
 
464 aa  490  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  52.89 
 
 
476 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  51.43 
 
 
488 aa  488  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  48.53 
 
 
469 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  48.25 
 
 
471 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  48.35 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  48.36 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  45.77 
 
 
470 aa  449  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  47.27 
 
 
469 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  44.25 
 
 
483 aa  427  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  45.87 
 
 
479 aa  423  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  43.92 
 
 
479 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  43.8 
 
 
483 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  42.94 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>