More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1502 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  100 
 
 
406 aa  820    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  86.52 
 
 
408 aa  725    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  74.94 
 
 
403 aa  610  1e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  76.7 
 
 
403 aa  605  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  64.93 
 
 
404 aa  550  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  32.49 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  34.11 
 
 
476 aa  216  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  32.95 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  32.41 
 
 
475 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  31.82 
 
 
476 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  31.81 
 
 
475 aa  209  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  29.98 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  29.74 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  29.74 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  30.16 
 
 
435 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  31.44 
 
 
469 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  28.94 
 
 
472 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 
434 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  28.67 
 
 
477 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.84 
 
 
470 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.97 
 
 
470 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.21 
 
 
483 aa  193  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.5 
 
 
482 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 
481 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  28.94 
 
 
472 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  30.27 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 
480 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  27.63 
 
 
465 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  27.63 
 
 
465 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  27.63 
 
 
465 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  26.94 
 
 
470 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  27.4 
 
 
465 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  27.4 
 
 
465 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  27.17 
 
 
465 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  27.4 
 
 
463 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  27.4 
 
 
465 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  27.4 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  27.17 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  26.91 
 
 
487 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  27.4 
 
 
465 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  29.14 
 
 
479 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  26.91 
 
 
487 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.67 
 
 
476 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  26.91 
 
 
487 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.38 
 
 
490 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  28.7 
 
 
471 aa  186  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 
470 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  26.68 
 
 
479 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  29.45 
 
 
471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 
485 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.97 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  27.25 
 
 
467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  27.63 
 
 
487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  27.8 
 
 
470 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  28.81 
 
 
465 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.74 
 
 
470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  28.37 
 
 
481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  28.44 
 
 
470 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  27.67 
 
 
472 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  27.59 
 
 
465 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  26.56 
 
 
499 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 
476 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  26.83 
 
 
470 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  27.92 
 
 
470 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  26.56 
 
 
467 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  28.57 
 
 
465 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  28.04 
 
 
487 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  26.83 
 
 
470 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  28.25 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  28.31 
 
 
471 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  26.83 
 
 
481 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.94 
 
 
475 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  27.63 
 
 
465 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  27.63 
 
 
465 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  27.91 
 
 
469 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.21 
 
 
485 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  28.54 
 
 
472 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  26.88 
 
 
471 aa  176  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  26.93 
 
 
465 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.97 
 
 
479 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  27.79 
 
 
471 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3040  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.13 
 
 
481 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3284  FeS assembly protein SufB  27.68 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  28.97 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04440  hypothetical protein  28.11 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30977  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  26.81 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  25.29 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  27.06 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.29 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  28.2 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2575  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.19 
 
 
481 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  27.11 
 
 
479 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.33 
 
 
479 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  28.28 
 
 
435 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3262  FeS assembly protein SufB  27.8 
 
 
482 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47258  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4355  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.39 
 
 
478 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.365891  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  28.43 
 
 
420 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.98 
 
 
479 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  31.34 
 
 
450 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  27.51 
 
 
479 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>