More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0712 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  64.63 
 
 		 465 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  65.02 
 
 		 485 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  64.21 
 
 		 465 aa  636    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  63.12 
 
 		 465 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  63.34 
 
 		 465 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  63.34 
 
 		 465 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  62.91 
 
 		 465 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  63.12 
 
 		 465 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  66.44 
 
 		 470 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  63.12 
 
 		 465 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  64.8 
 
 		 480 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  64.8 
 
 		 470 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  66.95 
 
 		 466 aa  674    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  65.77 
 
 		 470 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  63.56 
 
 		 465 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  64.85 
 
 		 465 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  64.57 
 
 		 479 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  62.91 
 
 		 465 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  64.63 
 
 		 465 aa  645    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  98.51 
 
 		 471 aa  963    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  64.18 
 
 		 473 aa  654    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  65.02 
 
 		 481 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  83.69 
 
 		 472 aa  837    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  65.94 
 
 		 465 aa  651    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  65.25 
 
 		 487 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  100 
 
 		 471 aa  978    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  65.25 
 
 		 470 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  65.92 
 
 		 481 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  64.19 
 
 		 485 aa  643    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  65.25 
 
 		 487 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  64.35 
 
 		 479 aa  634    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  65.92 
 
 		 470 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  67.26 
 
 		 482 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  91.08 
 
 		 471 aa  904    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  65.25 
 
 		 487 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  65.47 
 
 		 479 aa  638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  63.93 
 
 		 470 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  67.71 
 
 		 481 aa  653    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  68.47 
 
 		 465 aa  673    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  62.91 
 
 		 465 aa  636    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  69.34 
 
 		 469 aa  689    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  63.12 
 
 		 465 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  64.8 
 
 		 479 aa  634    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  62.66 
 
 		 485 aa  634    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  63.18 
 
 		 463 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  63.9 
 
 		 472 aa  631  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  63.68 
 
 		 476 aa  631  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  63.9 
 
 		 476 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  61.66 
 
 		 470 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  65.02 
 
 		 487 aa  627  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  61.7 
 
 		 477 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  60.99 
 
 		 483 aa  624  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  60.78 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  65.1 
 
 		 490 aa  625  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  64.8 
 
 		 487 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  63.51 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  60.35 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  65.25 
 
 		 482 aa  621  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  60.99 
 
 		 472 aa  619  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  62.02 
 
 		 466 aa  621  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  63.82 
 
 		 477 aa  616  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  61.29 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  62.31 
 
 		 478 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  62.88 
 
 		 475 aa  604  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  59.27 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  59.36 
 
 		 468 aa  594  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  58.57 
 
 		 469 aa  587  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  58.23 
 
 		 552 aa  581  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  58.39 
 
 		 469 aa  578  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  57.58 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  58.68 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  56.59 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  57.08 
 
 		 476 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  53.66 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  53.83 
 
 		 486 aa  539  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  54.21 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  54.09 
 
 		 467 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  54.31 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  54 
 
 		 476 aa  531  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  54.21 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  52.56 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  53.13 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  52.97 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  52.9 
 
 		 471 aa  508  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  50.85 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  50.64 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  51.17 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  51.08 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  48.6 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  49.89 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  51.01 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  48.49 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  47.1 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  47.1 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  45.86 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  45.8 
 
 		 483 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  43.78 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  45.03 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.66 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0893  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.52 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>