More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2037 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  100 
 
 
394 aa  807    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  45.74 
 
 
418 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  42.16 
 
 
420 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  42.42 
 
 
420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  35.57 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  38.19 
 
 
430 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  38.04 
 
 
430 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  38.04 
 
 
430 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  38.04 
 
 
430 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  38.04 
 
 
430 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  38.04 
 
 
430 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  38.04 
 
 
430 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  37.78 
 
 
430 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  37.78 
 
 
430 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  37.78 
 
 
430 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  35.92 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  36.01 
 
 
436 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  36.46 
 
 
430 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  35.48 
 
 
426 aa  230  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  34.83 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  37.35 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  37.35 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  29.05 
 
 
423 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  28.31 
 
 
405 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  30.98 
 
 
420 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  28.12 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  27.3 
 
 
405 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  26.81 
 
 
396 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 
479 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  28.21 
 
 
434 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  27.69 
 
 
479 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 
487 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  25.22 
 
 
499 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 
487 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 
487 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.16 
 
 
490 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  27.38 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  29.14 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  26.77 
 
 
477 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.85 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  27.79 
 
 
466 aa  131  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  26.54 
 
 
487 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  26.23 
 
 
481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  25.98 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  27.88 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  26.93 
 
 
467 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.15 
 
 
470 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  25.93 
 
 
485 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.46 
 
 
482 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.54 
 
 
487 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  27.45 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.77 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.15 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  27.61 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  24.25 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.49 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.31 
 
 
470 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.87 
 
 
479 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.97 
 
 
482 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  27.43 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  25.85 
 
 
480 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  25.84 
 
 
471 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  25.84 
 
 
471 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  26.46 
 
 
481 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  25.6 
 
 
552 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
479 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  26.81 
 
 
408 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  27.07 
 
 
455 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  24.69 
 
 
470 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  24.07 
 
 
476 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  24.47 
 
 
464 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  27.33 
 
 
439 aa  124  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  24.17 
 
 
464 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  24.69 
 
 
470 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  25.31 
 
 
470 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  23.77 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  28.21 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  25.54 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.97 
 
 
479 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0843  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.97 
 
 
479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177229  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  25.08 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  26.06 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  25.62 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  24.69 
 
 
470 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  24.32 
 
 
472 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
470 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
478 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  23.7 
 
 
469 aa  119  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  24.32 
 
 
465 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  24.62 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  24.62 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  26.92 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  23.46 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0893  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25.37 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  22.67 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  26.14 
 
 
465 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>