More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0488 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  100 
 
 
478 aa  1001    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  74.08 
 
 
486 aa  748    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  53.75 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  55.41 
 
 
477 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  54.6 
 
 
466 aa  531  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  52.56 
 
 
471 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  52.56 
 
 
471 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  54.9 
 
 
469 aa  528  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  56.63 
 
 
465 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  54.45 
 
 
470 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  56.85 
 
 
465 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  53.26 
 
 
483 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  53.25 
 
 
479 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  55.51 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  53.76 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  53.76 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  53.98 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  53.98 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  53.76 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  51.95 
 
 
473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  51.72 
 
 
471 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  54.42 
 
 
485 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  53.76 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  53.76 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  54.2 
 
 
479 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  54.19 
 
 
465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  53.98 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  53.78 
 
 
463 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  54.27 
 
 
468 aa  512  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  53.97 
 
 
487 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  53.97 
 
 
487 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  54.2 
 
 
485 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  53.97 
 
 
487 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  54.65 
 
 
469 aa  511  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  53.93 
 
 
481 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  53.74 
 
 
470 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  53.26 
 
 
470 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  51.73 
 
 
485 aa  510  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  52.6 
 
 
482 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  52.16 
 
 
470 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  53.74 
 
 
479 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  53.51 
 
 
479 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  52.83 
 
 
470 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  54.38 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  53.29 
 
 
470 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  51.07 
 
 
476 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  53.51 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  53.51 
 
 
480 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  53.2 
 
 
467 aa  505  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  53.25 
 
 
481 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  52.27 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  53.71 
 
 
465 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  51.07 
 
 
476 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  52.68 
 
 
470 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  51.41 
 
 
470 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  51.3 
 
 
487 aa  501  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  53.71 
 
 
465 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  51.74 
 
 
487 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  52.61 
 
 
466 aa  500  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  53.06 
 
 
481 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  52.61 
 
 
472 aa  501  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  53.97 
 
 
478 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  52.36 
 
 
472 aa  495  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  50.21 
 
 
482 aa  498  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  52.83 
 
 
470 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  50.22 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  51.93 
 
 
477 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  50.56 
 
 
472 aa  482  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  49.78 
 
 
469 aa  477  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  53.29 
 
 
475 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  48.73 
 
 
470 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  48.98 
 
 
552 aa  457  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  46.32 
 
 
470 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  47.07 
 
 
499 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  46.52 
 
 
462 aa  434  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  44.99 
 
 
467 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  43.24 
 
 
463 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  43.84 
 
 
475 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  42.11 
 
 
471 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  43.97 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  42.67 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  45.11 
 
 
471 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  43.12 
 
 
476 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  42.46 
 
 
464 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  42.92 
 
 
476 aa  414  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.56 
 
 
479 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  42.86 
 
 
476 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  46.74 
 
 
476 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  42.53 
 
 
469 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  42.86 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  45.27 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1468  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  42.83 
 
 
489 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454398  normal  0.0337836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0725  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  45.03 
 
 
482 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  43.35 
 
 
489 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  41.14 
 
 
472 aa  397  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1860  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  43.59 
 
 
478 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.89 
 
 
479 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0893  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.44 
 
 
479 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0195  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  42.89 
 
 
493 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.91 
 
 
479 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>