More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2916 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 410 aa  815    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  60.16 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  60.21 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  54.86 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  54.36 
 
 		 407 aa  398  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  53.45 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  54.64 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  57.26 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  54.31 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  53.28 
 
 		 416 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  56.01 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  52.24 
 
 		 407 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  52.51 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  54.13 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  54.76 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  52.26 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  52.23 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  53.01 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  51.69 
 
 		 384 aa  362  9e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  51.81 
 
 		 373 aa  359  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  50.53 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  51.53 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  52.28 
 
 		 440 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  51.21 
 
 		 401 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  50.39 
 
 		 389 aa  355  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  52.42 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  51.76 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  52.03 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  50.65 
 
 		 405 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  51.07 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  51.32 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  51.07 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  51.07 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  48.58 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  45.71 
 
 		 386 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  48.23 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  42.48 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  44.63 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  39.17 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  38.46 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  29.86 
 
 		 445 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  26.78 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  31.66 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  31.8 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  28.07 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  27.53 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  27.53 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  28.86 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  30.53 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  32.82 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  26.36 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  30.41 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  26.3 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  30 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  24.47 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  30.88 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  28.52 
 
 		 441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  34.76 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  32.06 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  32.06 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  30.88 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  32.39 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  27.4 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  28.46 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  28.98 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  26.14 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  26.13 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.14 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  29.29 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  26.38 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  29.68 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  31.03 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  28.21 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  31.79 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  33.17 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  30.27 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  32.6 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  33.14 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  30 
 
 		 459 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  28.05 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  32.16 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0561  SufBD protein  34.67 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  26.74 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  29.54 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  31.61 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  30.52 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  33.96 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  26.61 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  29.72 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  23.04 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  27.47 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  27.13 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  34.13 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  30.41 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  28.62 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  31.9 
 
 		 437 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  29.22 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  26.4 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  24.34 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>