More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2508 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 392 aa  783    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  70.21 
 
 		 393 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  68.64 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  67.09 
 
 		 399 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  66.49 
 
 		 396 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  66.49 
 
 		 396 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  68.28 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  69.09 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  65.87 
 
 		 389 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  66.48 
 
 		 390 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  60.85 
 
 		 372 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  60.85 
 
 		 372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  62.27 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  59.73 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  57.41 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  57.41 
 
 		 398 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  57.33 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  55.73 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  56.16 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  55.62 
 
 		 384 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  54.91 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  58.06 
 
 		 381 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  57.18 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  53.89 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  55.47 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  53.39 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  55.7 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  54.13 
 
 		 410 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  56.04 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  52.41 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  53.64 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  52.52 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  52.74 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  51.56 
 
 		 412 aa  360  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  51.28 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  52.33 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  42.34 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  43.36 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  32.46 
 
 		 434 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  30.39 
 
 		 445 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  40.44 
 
 		 453 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  29.19 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  28.71 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  27.99 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  32.32 
 
 		 435 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  28.57 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  29.31 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  32.07 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  31.06 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  33.04 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  27.33 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  24.88 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.92 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  29.25 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  29.33 
 
 		 455 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  28.88 
 
 		 446 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  29.64 
 
 		 437 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  29.15 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  31.14 
 
 		 459 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  28.53 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  34.56 
 
 		 444 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  30.03 
 
 		 437 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  32.02 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  29.02 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  28.42 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.91 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  30.41 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  32.02 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  33.79 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  27.21 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  27.21 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  28.94 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.92 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  28.78 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  25.56 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  30.42 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  27.32 
 
 		 442 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  29.96 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  26.63 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  27.4 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  26.67 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  27.57 
 
 		 447 aa  113  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  29.91 
 
 		 430 aa  112  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  26.86 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  27.53 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  26.63 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  26.63 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  26.56 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  23.33 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.38 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  28.95 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  29.06 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  28.22 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  24.94 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  26.1 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  23.49 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  27.19 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  25.25 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>