More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1656 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1656  SufBD protein  100 
 
 		 378 aa  760    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1907  FeS assembly protein SufD  41.69 
 
 		 384 aa  290  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1839  SufBD protein  27.57 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1169  SufBD protein  26.24 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.038096  normal  0.786569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0085  hypothetical protein  24.26 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0132  SufBD protein  24.93 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  24.1 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0125  hypothetical protein  23.05 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0190029  hitchhiker  0.00579103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  25.69 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  25.36 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  33.08 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2086  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.826381 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  26.54 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49608  FeS assembly protein suf  30.37 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  27.47 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  35.14 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1192  FeS assembly protein SufB  32.61 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1664  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.1 
 
 		 493 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2364  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.52 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.094709  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  30.23 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3966  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.85 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2328  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.1 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  32.82 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.1 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2994  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.1 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2742  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.1 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  25.59 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3309  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.29 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.0498365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.94 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  34.55 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  25.31 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3040  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  25 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2456  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.1 
 
 		 493 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1242  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  30.95 
 
 		 506 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  23.26 
 
 		 448 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  30.09 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  34.34 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3262  FeS assembly protein SufB  29.1 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5848  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  34.34 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1313  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  30 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00972882  normal  0.48939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  34.55 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  34.26 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  35.63 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  35.63 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.1 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2022  FeS assembly protein SufB  27.94 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126519  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3964  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.61 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00244471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  35.63 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.54 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  25.09 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.43 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0652  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.6 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0636  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.6 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  34.48 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0440  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  30.16 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119896  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.68 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  25.7 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0426  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.57 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  32.56 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1631  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  30.16 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190869  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  26.34 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2094  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  30.16 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0260072  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.94 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.33 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01357  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.36 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.456258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  28.36 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0415  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.57 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1233  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.32 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.737377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  25.82 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2362  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.37 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.59 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  32.73 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  34.48 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.29 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.26 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  36 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  31.67 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  32.43 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3355  FeS assembly protein SufB  28.36 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499735  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00821  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.94 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.795563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03021  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.07 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  30.77 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0075  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  28.68 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  27.16 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  34.83 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5109  FeS assembly protein SufB  27.61 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1436  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.87 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0910011  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0818  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.94 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.61 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.94 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01371  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.87 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  31.53 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2107  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  27.61 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862611  normal  0.0704835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2438  transport system  24.06 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.629208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  23.61 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4345  FeS assembly protein SufB  28.36 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>