147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1169 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1169  SufBD protein  100 
 
 		 370 aa  746    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.038096  normal  0.786569 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0125  hypothetical protein  70.81 
 
 		 372 aa  537  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0190029  hitchhiker  0.00579103 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0132  SufBD protein  65.48 
 
 		 369 aa  494  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0085  hypothetical protein  65.37 
 
 		 381 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1839  SufBD protein  31.98 
 
 		 375 aa  159  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1907  FeS assembly protein SufD  24.8 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1656  SufBD protein  26.24 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  24.18 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  26.16 
 
 		 437 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  25.95 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  26.12 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00821  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.54 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.795563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  22.26 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  21.9 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.17 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  31.36 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  22.26 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0056  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.51 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  24.17 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  21.53 
 
 		 430 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  21.9 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  21.9 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  21.9 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0075  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  21.83 
 
 		 480 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  21.9 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  21.9 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  21.9 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  33.85 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  33.85 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  33.85 
 
 		 397 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  37.5 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  20.8 
 
 		 467 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.54 
 
 		 500 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  30.51 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  40.62 
 
 		 372 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  33.85 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  26.71 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  21.53 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  26.06 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  21.1 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00851  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  21.83 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.927009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  27.1 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  20.22 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  24.19 
 
 		 459 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  33.85 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  20.47 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  34.92 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  34.38 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  37.74 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  23.64 
 
 		 467 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  27.8 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  34.38 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  28.93 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  21.09 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  21.09 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  20.59 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  22.26 
 
 		 470 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  20.59 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  20.59 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  24.31 
 
 		 479 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  20.59 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  20.59 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.9 
 
 		 482 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  20.59 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  20.59 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  21.83 
 
 		 480 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0426  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.54 
 
 		 480 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  22.08 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  39.62 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  27.2 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  36.07 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  22.18 
 
 		 479 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0415  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.54 
 
 		 480 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  24.35 
 
 		 476 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  22.86 
 
 		 425 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  22.64 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  30.77 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  24.27 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  20.73 
 
 		 439 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  25.18 
 
 		 477 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  20.22 
 
 		 423 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  21.9 
 
 		 470 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  25.22 
 
 		 476 aa  46.2  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3450  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  21.83 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00551493  hitchhiker  0.00000000835883 
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  23.69 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  26.8 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.18 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  28.95 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.66 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03021  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  22.54 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  21.9 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  23.69 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  24.27 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  21.9 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  23.08 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  23.77 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>